Ohne Erinnerung erwacht ein Mensch in einer ihm fremden Welt, verwandelt in ein Pokémon. Er sucht seine verlorene Vergangenheit und gründet ein Entdeckerteam. Nach einer vernichtenden Niederlage wird dem Team aufgetragen, die Welt vor dem Chaos zu retten.
Privatdetektiv Armin Erl reist in die ferne Triko-Region, um dem Fall des Legendenjägers Ray nachzugehen, der bereits drei legendäre Pokémon gefangen hat.